MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 chromosome

Total Repeats: 102985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009778	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009778	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009778	CTT	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009778	G	6	6	244	249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009778	GAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009778	AAT	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009778	ATC	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932230
8	NC_009778	GATC	2	8	390	397	25 %	25 %	25 %	25 %	156932230
9	NC_009778	TCG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932230
10	NC_009778	CG	4	8	519	526	0 %	0 %	50 %	50 %	156932230
11	NC_009778	A	6	6	702	707	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
12	NC_009778	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932231
13	NC_009778	ACG	2	6	808	813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932231
14	NC_009778	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
15	NC_009778	GAA	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932231
16	NC_009778	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
17	NC_009778	TAAAGG	2	12	1022	1033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156932231
18	NC_009778	AACG	2	8	1182	1189	50 %	0 %	25 %	25 %	156932231
19	NC_009778	GTA	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932231
20	NC_009778	CTG	3	9	1239	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932231
21	NC_009778	GAG	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156932231
22	NC_009778	GC	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	156932233
23	NC_009778	AGA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932233
24	NC_009778	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	156932233
25	NC_009778	TGG	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932233
26	NC_009778	GC	3	6	1631	1636	0 %	0 %	50 %	50 %	156932233
27	NC_009778	GCT	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932233
28	NC_009778	ATC	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932233
29	NC_009778	CTG	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932233
30	NC_009778	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156932233
31	NC_009778	GAA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932234
32	NC_009778	CTG	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
33	NC_009778	TGC	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
34	NC_009778	GC	3	6	1958	1963	0 %	0 %	50 %	50 %	156932234
35	NC_009778	A	6	6	1999	2004	100 %	0 %	0 %	0 %	156932234
36	NC_009778	GCT	2	6	2058	2063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
37	NC_009778	GAAGTC	3	18	2079	2096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156932234
38	NC_009778	GTC	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
39	NC_009778	A	6	6	2166	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	156932234
40	NC_009778	AAG	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932234
41	NC_009778	CGG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156932234
42	NC_009778	GGA	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009778	GTT	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009778	GTC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009778	A	7	7	2349	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	156932236
46	NC_009778	GGT	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
47	NC_009778	AAC	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932236
48	NC_009778	CAC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932236
49	NC_009778	GGT	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
50	NC_009778	TTG	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932236
51	NC_009778	CAA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932236
52	NC_009778	GTT	2	6	2474	2479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932236
53	NC_009778	TGC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
54	NC_009778	GGTT	2	8	2653	2660	0 %	50 %	50 %	0 %	156932236
55	NC_009778	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
56	NC_009778	CTGCGT	2	12	2765	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
57	NC_009778	CG	3	6	2810	2815	0 %	0 %	50 %	50 %	156932236
58	NC_009778	TGC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
59	NC_009778	TGC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
60	NC_009778	GTG	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
61	NC_009778	TGG	3	9	2941	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
62	NC_009778	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932236
63	NC_009778	GCA	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932236
64	NC_009778	AAT	2	6	3063	3068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156932236
65	NC_009778	TC	3	6	3093	3098	0 %	50 %	0 %	50 %	156932237
66	NC_009778	GAA	2	6	3131	3136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
67	NC_009778	AAG	2	6	3165	3170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
68	NC_009778	CGT	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932237
69	NC_009778	GTC	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932237
70	NC_009778	CGA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932237
71	NC_009778	GGTC	2	8	3281	3288	0 %	25 %	50 %	25 %	156932237
72	NC_009778	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	156932237
73	NC_009778	AAG	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
74	NC_009778	AGG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009778	TTC	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932239
76	NC_009778	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932239
77	NC_009778	CGT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
78	NC_009778	CGT	2	6	4116	4121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
79	NC_009778	GCG	2	6	4198	4203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156932240
80	NC_009778	GC	3	6	4259	4264	0 %	0 %	50 %	50 %	156932240
81	NC_009778	ACA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932240
82	NC_009778	CAC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932240
83	NC_009778	TGG	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932240
84	NC_009778	GCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
85	NC_009778	AAC	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932240
86	NC_009778	GCT	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
87	NC_009778	AGC	3	9	4402	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932240
88	NC_009778	GTC	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009778	AGC	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009778	CGT	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009778	GTAAAG	2	12	4686	4697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156932241
92	NC_009778	GCA	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932241
93	NC_009778	ACC	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932241
94	NC_009778	GCT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
95	NC_009778	CTG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
96	NC_009778	CGT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
97	NC_009778	ACTG	2	8	5016	5023	25 %	25 %	25 %	25 %	156932242
98	NC_009778	GTT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932243
99	NC_009778	TTG	3	9	5101	5109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932243
100	NC_009778	AAC	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932243
101	NC_009778	CT	3	6	5305	5310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009778	T	6	6	5344	5349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009778	AGT	3	9	5430	5438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009778	GC	3	6	5503	5508	0 %	0 %	50 %	50 %	156932244
105	NC_009778	ATC	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932244
106	NC_009778	CG	3	6	5602	5607	0 %	0 %	50 %	50 %	156932244
107	NC_009778	A	6	6	5616	5621	100 %	0 %	0 %	0 %	156932244
108	NC_009778	GTG	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932244
109	NC_009778	AAG	2	6	5655	5660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932244
110	NC_009778	TCG	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932244
111	NC_009778	TTC	2	6	5713	5718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932244
112	NC_009778	AAC	3	9	5721	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932244
113	NC_009778	AGC	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932244
114	NC_009778	ATC	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932244
115	NC_009778	TC	3	6	5806	5811	0 %	50 %	0 %	50 %	156932244
116	NC_009778	CGT	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932245
117	NC_009778	GTAAA	2	10	5909	5918	60 %	20 %	20 %	0 %	156932245
118	NC_009778	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	156932245
119	NC_009778	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932245
120	NC_009778	AACC	2	8	5998	6005	50 %	0 %	0 %	50 %	156932245
121	NC_009778	GCT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932245
122	NC_009778	A	6	6	6112	6117	100 %	0 %	0 %	0 %	156932245
123	NC_009778	TTC	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932245
124	NC_009778	AGT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009778	TAC	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
126	NC_009778	AGT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
127	NC_009778	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	156932247
128	NC_009778	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
129	NC_009778	CTG	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932247
130	NC_009778	GCA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932247
131	NC_009778	GCA	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932247
132	NC_009778	ATC	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
133	NC_009778	ATTACC	2	12	6630	6641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
134	NC_009778	ACT	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
135	NC_009778	TGA	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
136	NC_009778	CTG	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932247
137	NC_009778	CAAT	2	8	6734	6741	50 %	25 %	0 %	25 %	156932248
138	NC_009778	CTGAA	2	10	6798	6807	40 %	20 %	20 %	20 %	156932248
139	NC_009778	CGA	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932248
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142	NC_009778	GAAG	2	8	7183	7190	50 %	0 %	50 %	0 %	156932249
143	NC_009778	GGAACT	2	12	7234	7245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156932249
144	NC_009778	TGT	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932249
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151	NC_009778	A	6	6	7464	7469	100 %	0 %	0 %	0 %	156932250
152	NC_009778	CG	3	6	7669	7674	0 %	0 %	50 %	50 %	156932250
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227	NC_009778	TAG	2	6	11122	11127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_009778	CG	3	6	12006	12011	0 %	0 %	50 %	50 %	156932259
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243	NC_009778	ACT	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932259
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254	NC_009778	TCTG	2	8	12500	12507	0 %	50 %	25 %	25 %	156932259
255	NC_009778	TCG	2	6	12529	12534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932259
256	NC_009778	AG	3	6	12565	12570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009778	ACGC	2	8	12640	12647	25 %	0 %	25 %	50 %	156932260
258	NC_009778	AAG	2	6	12788	12793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932260
259	NC_009778	TACT	2	8	12872	12879	25 %	50 %	0 %	25 %	156932260
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261	NC_009778	GCA	2	6	12954	12959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932260
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263	NC_009778	GAA	2	6	13060	13065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932260
264	NC_009778	CTG	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932260
265	NC_009778	AGC	2	6	13140	13145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932260
266	NC_009778	TCG	2	6	13227	13232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932260
267	NC_009778	GCG	2	6	13234	13239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156932260
268	NC_009778	AAC	2	6	13253	13258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932260
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270	NC_009778	CGATC	2	10	13323	13332	20 %	20 %	20 %	40 %	156932260
271	NC_009778	CTG	2	6	13333	13338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932260
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284	NC_009778	A	6	6	14008	14013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009778	CGG	2	6	14021	14026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_009778	T	7	7	14028	14034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_009778	CGA	2	6	19188	19193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932267
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